龙穴遗址位于南朗镇龙穴村东南，珠江西岸的沙堤上。东南面对大海，离海边约400米，与珠海市淇澳岛隔海相望。龙穴遗址包括有偏北的新石器中期彩陶遗址(第二批市级文物保护单位)，偏南的新石器晚期至春秋战国时期的生活遗址。

1986年5月，中山市博物馆在进行野外调查时发现遗址偏南处有夹砂陶片暴露，其散布范围约三万平方米。所采集的文化遗物非常丰富，有陶器、石器和青铜器。陶器的陶质为夹砂陶，陶色有灰褐色、灰黑色及橙黄色。纹饰以绳纹为主，曲尺纹为次，印纹清晰，烧制火候不高，质地疏松。以轮制制作并辅以手制。陶器器形多样，有敞口、侈口圜底罐，带流圜底壶，口沿卷边器座等，出土遗物较为完整。此外还发现有单面铸铜器陶范。石器类用细砂岩石和卵石制成。有砺石、石锛、有段石锛、网坠、穿孔砑璋和铸铜石范。石范出土时仅剩单面，为铜斧状，范长12.7厘米，宽8厘米。青铜器类有残铜剑一件，长10.6厘米。

根据出土文化遗物分析，该处属于新石器晚期至相当于商周至春秋战国时期的沙丘遗址。

1988年8月，中山市博物馆与广东省博物馆进行考古时发现遗址偏北处有彩陶片，并试掘了两个探沟。1990年12月至1991年1月，广东省文物考古研究所、中山市文管办、市博物馆组成考古队对该处进行正式发掘，已掘面积约310平方米。堆积层分三层：第一层为表土层；第二层为扰土层，出土有明清时期的布纹瓦、青花瓷片及一枚北宋"景元宝"铜钱；第三层为文化层，灰褐色沙土，距地表深65－130厘米。上部深65－86厘米，含有彩陶、夹砂陶，但遗物较少，间有红烧土碎块和炭屑；下部深90－130厘米，细沙颜色较灰白，尤以深100－110厘米中含遗物较多。出土遗物陶器类有夹砂陶釜、陶器座、陶支脚和白陶片；彩陶有镂孔圈足盘、碗，为手制轮修，陶色砖红，彩纹为卷状水波纹、圆点、条带纹，圈足刻划水波纹、折线纹和弦纹。石器类有敲砸器、石锛、石锤、石球、砺石、石饼、石拍等。该处属于新石器中期沙丘遗址，距今约5500－5000年。1990年3月，龙穴彩陶遗址被中山市人民政府公布为第二批文物保护单位。